甲基化DNA标志物或预测胃癌

来源:今日科学 时间:2016/01/13 17:08 阅读:398
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胃癌研究有新进展吗?当然有,美国胃肠病学院2015年科学会议近期召开,根据本次会议上提交的一项研究新研究表明,在美国和韩国的队列中,多个甲基化DNA标志物可以准确地预测胃癌。


在这项研究中,我们通过全甲基化测序鉴定了新的甲基化DNA标志物,随后在美国和南韩的患者队列中确认了优等候选,”Bradley W.Anderson博士(梅奥诊所)在演讲中提到。


多个甲基化DNA标志物可以准确地预测胃癌


来自美国35名患者和韩国50名患者的17份甲基化DNA标志物候选具有完整的腺癌,Anderson和同事们对其进行了评估,并与对照组进行比较。美国组是与65名健康患者的正常胃黏膜上皮细胞对比。50名韩国患者在首尔大学医院接受治疗,作为自身对照组。据Anderson所说,在基线时取邻近的正常粘膜做样本。


对每一个标记物,应用逻辑回归分析计算曲线下面积(AUC)。来自显微组织的DNA是通过甲基化特异性聚合酶链式反应进行分析,通过β肌动蛋白对标志物水平标准化。


研究人员发现,前10位的DNA标记包括ARHGEF4ELMO1ABCB1CLEC11AST8SIA1SFMBT2CD1DCYP26C1ZNF569C13ORF18

10个标志物检测出美国组胃癌率为接近满分,南韩检测率为94%,其特异性为95%


美国队列各标志物的AUCs分别为ARHGEF40.92ELMO10.91ABCB10.89CLEC11A0.88ST8SIA10.85SFMBT20.82CD1D0.82CYP26C10.81ZNF5690.75C13ORF180.66


南韩队列各标记的AUCs分别为ARHGEF40.73ELMO10.9ABCB10.78CLEC11A0.75ST8SIA10.8SFMBT20.94CD1D0.87CYP26C10.79ZNF5690.75C13ORF180.79


这些标志物准确性高,而且一些标记在两组的判别中相似,”Anderson说。


特殊标志物,比如ELMO1在两个患者组都表现出高识别率。然而,其它标记,包括ARHGEF4,由于横跨正常组和患者组的背景,识别率更具多样。


在美国组和南韩组中,研究人员鉴定出对胃癌具有高敏感性和特异性的有益甲基化DNA标志物,Anderson总结说。将这些候选甲基化DNA标志物批准用于早期胃癌,还需要进一步研究。


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