利用噬菌体辅助进化产生更高 效的腺嘌呤碱基编辑器

来源:医生在线 时间:2020/03/30 11:56 阅读:3420
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  美国哈佛大学刘如谦(DavidR.Liu)研究小组利用噬菌体辅助进化,产生了具有Cas结构域兼容性与活性提升的腺嘌呤碱基编辑器(ABE)。2020年3月17日,《自然—生物技术》杂志在线发表了这一较 新研究成果。

  ABE的应用受到脱氧腺苷脱氨酶组分与SpCas9以外Cas同系物的有限兼容性限制。研究人员使用噬菌体辅助的非连续和连续进化(PANCE和PACE)来改进了ABE7.10的脱氨酶成分,从而产生了ABE8e。与ABE7.10相比,ABE8e包含8个额外的突变,可将活性(kapp)提高590倍。
腺嘌呤碱基
  与各种Cas9或Cas12同源物配对时,ABE8e可以大大提高编辑效率。ABE8e比ABE7.10更具处理能力,这可能有益于筛选、调节区域的破坏和多重碱基编辑应用程序。

  通过在TadA-8e域中引入其他突变,可以改善Cas9依赖性和非依赖性DNA脱靶编辑以及转录组范围的RNA脱靶编辑的一定增加。

  较后,研究人员证明ABE8e可以有效地实现天然突变,从而在人细胞中BCL11A增强子或HBG启动子中上调胎儿血红蛋白的表达,而这些靶点被ABE7.10编辑的效果不佳。ABE8e增强了腺嘌呤碱基编辑的有效性和适用性。

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