全外显子组测序揭示小细胞肺癌或是一种遗传病！
来源：医生在线
时间：2021/03/11 17:09
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目前，人们普遍认为小细胞肺癌患者大概率是由于接触了烟草，而产生了易感性。在该研究中，研究人员对77位SCLC患者和10位肺外小细胞癌（EPSCC）患者的种系外显子组（germlineexomes）进行测序，以评估受试者对SCLC的遗传敏感性。他们检测了607个基因，在43.7％的患者中的35个癌症易感基因中发现了42个有害突变。然后，在79名SCLC患者的独立队列中验证了这些发现。
研究人员还表示，与健康对照组相比，非选择性SCLC患者更可能携带RAD51D、CHEK1、BRCA2和MUTYH致病突变，并且种系基因型与一级相对癌症或肺癌的可能性显著相关，而且经过铂类化疗后，无复发生存期更长。
为了探索SCLC和EPSCC的遗传基础并鉴定出潜在的易感基因，研究人员对87位非选择性患者的外显子组进行了测序，并将致病种系突变的频率与外显子组整合数据库（ExACAggregationConsortium，ExAC）队列的53105名无癌的非芬兰欧洲个体进行了比较。
大多数患者现在或先前吸烟，但有8位是从未吸烟者，其中3人有非肺原发灶。当研究人员对607个基因的变异进行深入的人工分析时，他们发现了1131个非沉默突变，其中6个是致病的，45个可能是致病的，880个意义不确定，200个是良性或可能是良性的。排除非癌症基因的突变后，在35个基因中总共鉴定出42个致病或可能致病的突变。
研究人员发现，大多数常见的突变基因与DNA修复途径有关，其余基因参与生长因子受体、细胞周期、Wnt、转运体、DNA甲基化等途径。
在整个队列中，共有38名患者（43.7％）在35个癌症易感基因中携带了致病性或可能致病性的种系突变。3名患者有一个以上的致病种系突变。根据一位癌症遗传学家的二次回顾，9名患者的种系基因型影响了他们对高危家庭成员的医疗管理和检测。此外，队列中11.5%的患者在ACMG 的次要发现基因中存在有害突变，10.3%的患者在24个ACMG定义的癌症基因中存在有害突变，在77个癌症易感基因中19.5%的患者存在致病性突变。
研究人员还特别发现，作为DNA修复基因的RAD51D、CHEK1和BRCA2中遗传的功能丧失突变在SCLC患者中比在对照组中更为频繁。
总之，这些发现表明，小细胞肺癌的致癌作用不仅受烟草暴露驱动，而且还可能受种系遗传背景的影响。研究结果确定了SCLC患者的亚型，其中种系基因型可以指导预后和靶向治疗的选择。
为了探索SCLC和EPSCC的遗传基础并鉴定出潜在的易感基因，研究人员对87位非选择性患者的外显子组进行了测序，并将致病种系突变的频率与外显子组整合数据库（ExACAggregationConsortium，ExAC）队列的53105名无癌的非芬兰欧洲个体进行了比较。
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研究人员发现，大多数常见的突变基因与DNA修复途径有关，其余基因参与生长因子受体、细胞周期、Wnt、转运体、DNA甲基化等途径。
在整个队列中，共有38名患者（43.7％）在35个癌症易感基因中携带了致病性或可能致病性的种系突变。3名患者有一个以上的致病种系突变。根据一位癌症遗传学家的二次回顾，9名患者的种系基因型影响了他们对高危家庭成员的医疗管理和检测。此外，队列中11.5%的患者在ACMG 的次要发现基因中存在有害突变，10.3%的患者在24个ACMG定义的癌症基因中存在有害突变，在77个癌症易感基因中19.5%的患者存在致病性突变。
研究人员还特别发现，作为DNA修复基因的RAD51D、CHEK1和BRCA2中遗传的功能丧失突变在SCLC患者中比在对照组中更为频繁。
总之，这些发现表明，小细胞肺癌的致癌作用不仅受烟草暴露驱动，而且还可能受种系遗传背景的影响。研究结果确定了SCLC患者的亚型，其中种系基因型可以指导预后和靶向治疗的选择。
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