波士顿儿童医院试验证明新生儿ICU中快速全基因组测序的检测方案具有较高的诊断率

来源:医生在线 时间:2020/01/13 15:43 阅读:561
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许多进入重症监护室的新生儿(NICU),临床表现差异很大,从重要的结构畸形或生化异常到更细微的体征和症状,其中有一部分最终被诊断出遗传病因。这些异常共同导致发病率和死亡率显着增加,传统的、侵入性的和/或昂贵的诊断途径通常很长,需要进行广泛的评估。

全外显子和全基因组测序(WES /WGS)越来越多地用于加速包括新生儿重症监护病房(NICU)在内的各种临床环境中的诊断过程。已有的几篇NICU(重症监护室的新生儿)全外显子的研究文章显示诊断阳性率在21%-60%左右,但是究竟哪些新生儿患者做检测受益最 大还不太清楚,随着临床全外显子和全基因组测序WES/WGS的应用面不断扩大,行业越来越迫切需要确定哪些患者将从这些技术中受益最 大,尤其是对于那些缺乏临床遗传学专业知识的机构。 为了满足以上的临床需求,最近波士顿儿童医院的专家们在知名期刊Genetics in Medicine上发表了一篇文章详细讨论了这方面的问题。

新生儿ICU中快速全基因组测序的检测方案具有较高的诊断率

在这项研究中,测试了基于表型的决策算法的实用性,将快速外显子组测序作为一线检测方案,以诊断性获益和临床管理变化作为结果衡量指标。最近的一项研究表明,对所有未分层的新生儿重症监护病房(NICU)的婴儿进行测序可能会降低诊断率。虽然基于专家审阅意见来选择送检患者可提高诊断率,但是,临床实践中越来越多地使用下一代测序与临床遗传学受训人数的减少之间的差距日益扩大,这凸显了制定用于控制遗传学检测的客观标准的重要性。

本文的总诊断率(58%)与使用专家意见的患者选择的研究相当或更高,患者满足的表型标准越多,WES诊断出来的可能性就越大。按指征细分来看,具有神经系统表现的患者中发现最 高的诊断阳性率。表现为低肌张力或癫痫发作的患者的诊断率分别为80%(p = 0.01)和90%(p =0.02)(并且有两种症状的6名儿童的诊断率为100%[p = 0.03])。先天多发畸形的诊断阳性率为64%,具有复杂代谢表型的患者的阳性率为50%(两者在统计学上均与总产率无显着差异)。

总之,本文发现,表型驱动的新生儿ICU中快速全基因组测序的检测方案具有较高的诊断率(58%),并能对患者和家属进行切实的管理改变。在NICU中推广基于表型的检测方案可以更快,更准确地进行诊断,减少不必要的检测,并改善医疗保健。

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